Kamenný vrch u Kurdějova
Opuštěná pastvina s teplomilnou květenou a chráněnými druhy rostlin jako je hlaváček jarní, čilimník bílý, kosatec různobarvý a další.
Lednické rybníky - národní přírodní rezervace
Rezervace zahrnuje celkem šest vodních ploch: rybník Nesyt (největší moravský rybník), Hlohovecký, Prostřední a Mlýnský rybník, které jsou spojeny v jednu soustavu, a dva odlehlejší rybníky ležící v lednickém zámeckém parku - Zámecký a Podzámecký. Rybníky založené ve středověku se řadí mezi nejvýznamnější ornitologické lokality v republice. Rezervací prochází naučná stezka.
Lednicko-valtický areál - kulturní krajina
Kulturní krajina přetvořená rodem Lichtenštejnů. Zámky a další romantické stavby v lesích a parcích mezi městy Valtice, Břeclav, Lednice a Mikulov.
Pastvisko u Lednice - národní přírodní památka
Mokřadní louky s porosty rákosu a křovitých vrb. Hnízdiště hus, kachen, chřástalů a dalších bahenních ptáků. Ornitologická lokalita nadregionálního významu.
Plácky - přírodní památka
Mokřady s cennou slanomilnou vegetací.
Pouzdřanská step-Kolby - národní přírodní rezervace
Teplé klima a vápenité pískovce podpořily vznik stepních společenstev, které jsou nedaleko Pouzdřan chráněny v národní přírodní rezervaci. Z rostlin se zde vyskytují například kavyl sličný, koniklec velkokvětý a luční, hlaváček jarní, kostřava valiská či katrán tatarský.
Rendezvous - národní přírodní památka
Doubrava obestírající romantický zámeček Randezvous. Na písčitém podkladu se daří dubu céru a přirozené teplomilné květeně. Odborníci z řad mykologů si cení území jako jedinečné lokality s výskytem vzácných druhů dřevokazných hub.
Františkův rybník
Území s výskytem kriticky a silně ohrožených vodních, mokřadních a polostepních druhů rostlin, významná hydrobiologická lokalita a pro rozmnožování obojživelníků, hnízdiště zvláště chráněných silně ohrožených a ohrožených druhů ptáků.
Břeclav
Hochberk
Svahy Žlutého kopce mají charakter suchých stepních trávníků a lesostepi. Mezi hlavní předměty ochrany patří katrán tatarský, čilimník bílý a len chlupatý pravý.
Popice
Kameníky
Suché stepní trávníky s výskytem křovin. Vyskytuje se zde kriticky ohrožená pampeliška pozdní.
Valtice
Křivé jezero - národní přírodní rezervace
Mrtvé rameno Dyje s posledními lužními lesy typickými pro podpálavskou oblast. Stromové patro tvoří dub letní a vrby hlavaté. Každé jaro pokryje zem koberec bledulí jarních. Svá hnízdiště mají v rezervaci husy velké, čáp bílý, luňák hnědý, orel mořský.
Nosperk
Dřínové, habrové a bukové doubravy se zachovalým bohatým podrostem a četné palouky se vzácnou květenou.
Němčičky
Trkmanec-Rybníčky
Zachovalý zbytek slaniska - vlhké louky se slanomilnými druhy. Zvláště chráněný je zejména kriticky ohrožený pcháč žlutoostenný. Biotop plní také funkci hnízdiště a tahové zastávky mokřadních ptáků.
Rakvice
Úvalský rybník
Mokřadní biotop údolní nivy malého vodního toku s rybníkem a bohatým výskytem obojživelníků, mezi nimi zejména evropsky významného druhu kuňky obecné. Hnízdí zde také mokřadní ptáci.
Valtice
Věstonická nádrž
Významný vodní a mokřadní ekosystém s funkcí ochrany zvláště chráněných druhů rostlin a živočichů.
Dolní Věstonice
Zimarky
Stráň se stepní loukou, na které roste silně ohrožený teplomilný druh katrán tatarský. Vyskytují se zde i další vzácné druhy rostlin.
Velké Bílovice
Hrádek
Morkůvky
Jesličky
Němčičky
Kamenice u Hlohovce
Hlohovec
Květné jezero
Lednice
Lipiny
Kurdějov
Národní přírodní památka Kukle
Boleradice
Přední kopaniny
Hustopeče
Přírodní rezervace Zázmoníky
Bořetice
Stračí
Horní Bojanovice
Velký Kuntínov
Boleradice
